進むミクロスケールのコネクトームの公開

2024年4月24日
全体に公開

コネクトーム(connectome)は、神経系のすべての神経細胞が接続することでできた神経回路の全体のことです。このところ、このようなデータベースの公開についての発表が相次いていますので、紹介したいと思います。電子顕微鏡で撮影した神経系をビジュアルに見やすいように描き出すことで、神経系の成り立ちを理解しようとするものです。とりあえず、YouTubeでの動画を見て、神経系を眺めてみるということでお楽しみください。こういう構造を作ったり、操作したりするのが、合成生物学の未来となると思います。

📌ショウジョウバエ視覚系

バージニア州にあるHHMI Janelia Research Campusの研究チームは、ショウジョウバエの視覚系を構成する 50,000 個を超えるニューロンの包括的なマップであるコネクトームを公開しました(bioRxiv、4月18日)。 このデータは、視覚がどのように機能するかについての理解を深め、人間の視覚システムなどのより複雑な視覚システムを理解するのに役立ちます。 コネクトームは、高解像度の電子顕微鏡とコンピューター分析を使用して作成されました。

Connectome-driven neural inventory of a complete visual system
Vision provides animals with detailed information about their surroundings, conveying diverse features such as color, form, and movement across the visual scene. Computing these parallel spatial features requires a large and diverse network of neurons, such that in animals as distant as flies and humans, visual regions comprise half the brain’s volume. These visual brain regions often reveal remarkable structure-function relationships, with neurons organized along spatial maps with shapes that directly relate to their roles in visual processing. To unravel the stunning diversity of a complex visual system, a careful mapping of the neural architecture matched to tools for targeted exploration of that circuitry is essential. Here, we report a new connectome of the right optic lobe from a male Drosophila central nervous system FIB-SEM volume and a comprehensive inventory of the fly’s visual neurons. We developed a computational framework to quantify the anatomy of visual neurons, establishing a basis for interpreting how their shapes relate to spatial vision. By integrating this analysis with connectivity information, neurotransmitter identity, and expert curation, we classified the ∼53,000 neurons into 727 types, about half of which are systematically described and named for the first time. Finally, we share an extensive collection of split-GAL4 lines matched to our neuron type catalog. Together, this comprehensive set of tools and data unlock new possibilities for systematic investigations of vision in Drosophila , a foundation for a deeper understanding of sensory processing. ### Competing Interest Statement The authors have declared no competing interest.
www.biorxiv.org

📌マウスMICrONSプロジェクト

国際的な研究チームである「Machine Intelligence from Cortical Networks (MICrONS) プログラム」は、マウスの視覚野の立方ミリメートル領域の3D電子顕微鏡による再構成と、同じ領域からのニューロン活動の蛍光イメージングに成功しました。これは、脳の複雑な構造と機能の理解において画期的な成果です。

この研究は、脳のシナプスレベルの組織を解明し、臓器の多くの機能を調整する回路を図示することを目的とした「コネクトミクス」分野における重要な一歩です。得られたデータは、神経科学コミュニティにとって貴重なリソースとなるだけでなく、人工知能の開発にも役立つ可能性があります。

Schmidt, M. et al. (2024) RoboEM: automated 3D flight tracing for synaptic-resolution connectomics. Nat Methods

しかし、これはまだ脳全体のほんの一部分にすぎません。研究者たちは、脳全体をマッピングし、その仕組みを完全に理解するためには、さらなる技術革新と資金が必要です。

MICrONS Explorer

合成生物学は新たな産業革命の鍵となるか?」担当:山形方人

【合成生物学ポータル】 https://synbio.hatenablog.jp

【Twitter】  https://twitter.com/yamagatm3

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