国内感染、累計5千人迫る 埼玉、東京で計5人死亡

予想されていた動きだと思います。
非常事態宣言による外出制限の効果が出るのは早くても1週間以上先です。現時点で感染している人の発症や、死亡は今後もしばらくは続くでしょう。
現時点で東京の医療機関は通常診療の継続は難しくなってきていますが、新型コロナウイルス感染症に対する治療や重症病床はなんとか確保できている、ギリギリのラインでしょう。この状態を維持し、そこから下降傾向になることを祈りたいです。

問題はこの非常事態宣言に伴う人の移動がどれだけ生じるかです。
現在地方ではまだ感染者はそこまで増えていません。地方は都会より集中治療などの環境が整っておらず、重症化したコロナウイルス肺炎患者を受け入れるキャパシティがあるかの問題が生じます。特に、地方の医療機関でクラスターが発生した場合には、一挙に地域医療が崩壊する可能性もあります。

現在東京にいる方は、不自由でも現所在地に留まってください。感染を広げる行動は出来る限り避けましょう。